Tidak semua jenis file video dapat diputar di windows media player. Ia hanya dapat memutar beberapa tipe file saja yang secara umum dapat dikenali oleh windows seperti .avi, .mp4, .wmv, sedangkan banyak file video yang tidak dapat disetel dengan windows media player tersebut, seperti file berekstensi .mov, .flv, .swf, .ogv, .mkv, .3gp, dan masih banyak jenis video lainnya.